Jaunpiebalgas vidusskola realizē šādas izglītības programmas:

• Vispārējās pirmsskolas izglītības programma (kods 01011111)
• Pamatizglītības programma ( 1.- 9.kl.) (kods 21011111)
• vispārējās vidējās izglītības programma (kods 31016011)
• Speciālās izglītības programma izglītojamajiem ar mācīšanās traucējumiem (kods 21015611)
• Speciālās pamatizglītības programma izglītojamajiem ar garīgās attīstības traucējumiem (kods 21015811)
• Speciālās pirmsskolas izglītības programma izglītojamajiem ar fiziskās attīstības traucējumiem (kods 01015311)